Juno fue un miembro de la Primera Civilización, raza que creó a los humanos para servirles. Sin embargo, estalló una guerra entre las dos civilizaciones, que terminó con la destrucción de casi todos los miembros de Aquellos Que Vinieron Antes y la muerte de todos los humanos. Juno, Minerva, y otros miembros de la Primera Civilización restauraron la raza humana y quedaron ocultos en diversos templos, Juno se instaló debajo de lo que siglos más tarde sería el ColiseoRomano.
Era Romana
Juno fue una de los muchos dioses y diosas de la República Romana y posteriormente del Imperio Romano hasta la conversión al cristianismo del Imperio. El Asesino humano Marco Junio Bruto llegó a ver el Templo de Juno alrededor del 44 a.C.
En 2012, Juno fue visitada en su cámara por los Asesinos Desmond Miles—descendiente de Ezio Auditore—, Lucy Stillman, Rebecca Crane y Shaun Hastings para recuperar la Manzana que Auditore dejó allí quinientos cinco años atrás. Juno se apareció a Desmond durante su viaje desde el exterior del Coliseo hasta la cripta. Cuando Miles tocó la Manzana, Juno le reveló la verdad sobre Stillman, era una templaria en realidad. A través del fruto Desmond tuvo que decidir qué hacer, Juno le mostró lo que ocurriría si Lucy seguía con vida, cómo los traicionaría, y le empujó a apuñalar con la Cuchilla Oculta a su amiga, causándole la muerte.
Aunque quien le obligó a tomar esa decisión fue Juno a través del fruto, Desmond aclaró que él no se opuso a esa acción, y en cierta forma estuvo de acuerdo con hacerla, ya que podría haberse opuesto de forma más firme y haberlo evitado, pero no lo hizo.
Juno reaparece posteriormente en uno de los templos de los primeros hombres, donde le explicó a Desmond cómo la Primera Civilización intentó evitar la catástrofe que les llevó a su extinción.
Primeramente decidieron crear una serie de torres que generarían un escudo protector, pero ni siquiera fueron capaces de construir una de estas torres, y aunque automatizaron el proceso para que se construyera, el proceso era muy lento.
También idearon los frutos como medida para evitar su extinción, estos tenían la capacidad de controlar a los humanos, pero igualmente podían materializar los pensamientos de estos, por lo que usaron los frutos para crear todo tipo de cosas y pensaron que podría usarse para crear un escudo que les protegiese, pero igualmente aunque generaron en los humanos un sentimiento de esperanza, de querer salvarse, el fruto no fue capaz de generar ni siquiera una mínima parte del escudo que debía crear. Ni siquiera sirvió lanzar 11 de estos artefactos al espacio para intentarlo, todos los intentos fueron en vano.
También intentaron crear una raza superior que sobreviviera al desastre, pero fue totalmente inútil.
Como última medida, intentaron almacenar todo su conocimiento en un material que jamás pereciese, de esa forma, el conocimiento de su raza no desaparecería, al contrario de lo que pasaría con la carne de las criaturas débiles.
Una vez ocurrió el cataclismo, los humanos lograron sobrevivir a pesar de ser diezmados, pero gracias a los intentos de la Primera Civilización, el conocimiento de estos perduró.
Para preservar este conocimiento se utilizaron diferentes medios. Juno fue algo más lejos según explica en Assassin's Creed III: almacenó todo su conocimiento, todo su ser, su personalidad, y la información que conocía en un medio especial, de esta forma cuando volviese a suceder, ella podría volver a la "vida" y hacer frente a la situación con todos los conocimientos previamente adquiridos y los que conseguiría tras miles de años encerrada en dicho medio.
Tras guiar a Desmond para reactivar el templo y explicarle cómo salvarlo, le pide que sacrifique, y con su sacrificio activar completamente el dispositivo en el que estaba almacenada la conciencia de Juno, y de esa forma devolverla a la vida para que salvase a la eternidad.
A pesar de parecer algo tan simple, Minerva aparece para explicar el resto de la historia, ella discute con Juno y le pide a Desmond que no lo haga, si no activa el dispositivo, él sobrevivirá, junto con algunos más, pero el resto de la humanidad perecerá, eso llevará a que una nueva generación de humanos supervivientes se establezca poco a poco en los restos que queden de la Tierra, con él como gobernante de todos ellos.
Primero Desmond sería tratado como un líder, después como un rey, luego como una leyenda, y finalmente sería elevado a la categoría de Dios. Pero la humanidad no es perfecta, y volvería a repetirse el mismo ciclo, la sociedad se volvería corrupta de nuevo y esto llevaría a un nuevo colapso de toda la humanidad, volviendo a repetirse el ciclo de forma eterna.
Sin embargo Juno puede deshacer el ciclo a un alto coste, los humanos sobrevivirán, pero Desmond morirá y los humanos se convertirán en esclavos de Juno, la única superviviente de la Primera Civilización, que volvería a la vida gracias a este sacrificio.
Finalmente Desmond toma una decisión y Juno es liberada, creando un escudo protector que evita que el Sol destruya la vida en la Tierra, pero a costa de la muerte de Desmond y de la esclavitud de la humanidad.
Juno es parte de los antiguos titanes, su liberacion ha encadenado al mundo
En la mitología romana, el epíteto de Juno Moneta se traducecomo "el que advierte" que puede estar relacionado con las advertencias que le da a Desmond sobre su futuro y la "Cruz" que probablemente se refiere a Industrias Abstergo.
Lucina, otro de los epítetos de Juno, siginifica "la que trae a los niños a la luz", que también puede estar relacionado con el Sexto Sentido.
Juno también se ha referido como Pomona, que significa Diosa de la Fruta, lo que puede dar una pista de la posesión de la Manzana de Edén en algún momento de su vida.
En Assassin´s Creed III, al final del juego Juno dice que la unica forma de salvar a la humanidad es que la dejen esclavizarla para que no se pudiera volver a repetir el ciclo y que no se destruya a si misma, al parecer comparte las mismas metas de los templarios esta Juno.
Juno aplico la eutanasia a su propio esposo debido a que este participo en un experimento para sobrevivir al desastre solar pero este salio mal y le causo un sufrimiento inhumano suplicando su muerte.
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